AT5G44140.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:mitochondrion 1.000 ASURE: mitochondrion What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : prohibitin 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
prohibitin 7 (PHB7); INVOLVED IN: biological_process unknown; LOCATED IN: mitochondrion, respiratory chain complex I, membrane; EXPRESSED IN: leaf; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Prohibitin (InterPro:IPR000163), Band 7 protein (InterPro:IPR001107); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: prohibitin 2 (TAIR:AT1G03860.3); Has 4401 Blast hits to 4399 proteins in 1362 species: Archae - 186; Bacteria - 2303; Metazoa - 487; Fungi - 338; Plants - 217; Viruses - 14; Other Eukaryotes - 856 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:+:17762491..17763629 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 30761.20 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 10.18 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.21 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 278 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MNVKKVPNVP GSPALSALLK LGVIGGLGLY CIGSSMYNVD GGHRAIVFNR FTGIKDRVYP EGTHFKIPLF ERAIIYDVRS RPYVENSQTG SNDLQTVTIG 101: LRVLTRPMGD RLPEIYRTLG QNYGERVLPS IINETLKAVV AQYNASHLIT QREAVSREIR KIVTERAAKF NIALDDVSIT NLKFGKEFTE AIEKKQVAAQ 201: EAERAKFIVE KAEQDKKSAI IRAQGEAKSA QLIGQAIANN EAFITLRKIE AAREIAQTIA KSANKVYLNS SDLLISKQ |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)