AT5G39000.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Malectin/receptor-like protein kinase family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Malectin/receptor-like protein kinase family protein; FUNCTIONS IN: kinase activity; INVOLVED IN: protein amino acid phosphorylation; LOCATED IN: endomembrane system; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein kinase, ATP binding site (InterPro:IPR017441), Malectin/receptor-like protein kinase (InterPro:IPR021720), Protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR000719), Serine-threonine/tyrosine-protein kinase (InterPro:IPR001245), Protein kinase-like domain (InterPro:IPR011009), Serine/threonine-protein kinase, active site (InterPro:IPR008271); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Malectin/receptor-like protein kinase family protein (TAIR:AT5G38990.1); Has 116422 Blast hits to 114937 proteins in 4415 species: Archae - 91; Bacteria - 12945; Metazoa - 43415; Fungi - 9851; Plants - 32921; Viruses - 374; Other Eukaryotes - 16825 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:+:15611860..15614481 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 97169.60 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.99 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.18 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 873 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MIRHALLIFS ILVSTPIVGE GATSTYEPTD VFLFNCGDTS NNVDVSGRNW TAENQKILSS NLVNASFTAQ ASYQESGVSQ IPYMTARIFR SEFTYSFPVT 101: PGSNFLRLYF YPTRYGSQFN AVKSFFSVKV NGFTLLNNFS ADLTVKASKP QTEFIIKEFI IPVYQTLNLT FTPSLDSLAF VNGIEIVSIP NRFYSKGGFD 201: DVITNVGSSV DFHIENSTAF ETVYRLNVGG KTVGDSGMFR RWVSDDEIIL SESSGISPIV PDIKINYTEK TPSYVAPDDV YATSRSMGNA DHPEQNLNFN 301: LTWLFTVDAG FSYLVRLHFC ETLSEVNKEG QRVFSIFIEN QTATLEMDVF RMSGGSWIPM YLDYTVIAGS GSGRRHDLRL DLHPLVSINP KYYDAILNGV 401: EILKMNDPDG NLAGPNPDPL VSPDLIPNRA TPRIRKNKSH ILPITLAVVG SLVVLAMFVV GVLVIMKKKK KSKPSTNSSW CPLPHGTDST NTKPAKSLPA 501: DLCRRFSIFE IKSATNDFED KLIIGVGGFG SVYKGQIDGG ATLVAVKRLE ITSNQGAKEF ETELEMLSKL RHVHLVSLIG YCDEDNEMVL VYEYMPHGTL 601: KDHLFRRDKT SDPPLSWKRR LEICIGAARG LQYLHTGAKY TIIHRDIKTT NILLDENFVT KVSDFGLSRV GPTSASQTHV STVVKGTFGY LDPEYYRRQV 701: LTEKSDVYSF GVVLLEVLCC RPIRMQSVPP EQADLIRWVK SNYRRGTVDQ IIDSDLSADI TSTSLEKFCE IAVRCVQDRG MERPPMNDVV WALEFALQLH 801: ETAKKKNDNV ESLDLMPSGE VGTTTDGEDD LFSRTTGHVG KSTTTDDSVL VVGDERSGSS WGVFSEINEP KAR |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)