AT5G36150.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.964 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : putative pentacyclic triterpene synthase 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
putative pentacyclic triterpene synthase 3 (PEN3); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Terpene synthase, conserved site (InterPro:IPR002365), Terpenoid cylases/protein prenyltransferase alpha-alpha toroid (InterPro:IPR008930), Squalene cyclase (InterPro:IPR018333), Prenyltransferase/squalene oxidase (InterPro:IPR001330); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: baruol synthase 1 (TAIR:AT4G15370.1); Has 1967 Blast hits to 1902 proteins in 558 species: Archae - 4; Bacteria - 834; Metazoa - 81; Fungi - 233; Plants - 606; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 209 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:-:14220737..14225422 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 87808.20 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.30 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.25 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 760 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MWRLRIGAKA GDDPHLCTTN NFLGRQIWEF DANAGSPAEL SEVDQARQNF SNNRSQYKAC ADLLWRMQFL REKNFEQKIP RVRIEDAKKI TFEDAKNTLR 101: RGIHYMAALQ SDDGHWPSEN AGCIFFNAPF VICLYITGHL DKVFSEEHRK EMLRYMYNHQ NDDGGWGIDV ESHSFMFCTV INYICLRIFG VDPDHDGESA 201: CARARKWIID HGGATYTPLF GKAWLSVLGV YEWSGCKPIP PEFWFFPSYF PINGGTLWIY LRDTFMAMSY LYGKKFVAKP TPLILQLREE LYPQPYAEIV 301: WSQARSRCAK EDLYYPQSLV QDLFWKLVHM FSENILNRWP FNKLIREKAI RTAMELIHYH DEATRYITGG AVPKVFHMLA CWVEDPESDY FKKHLARVSH 401: FIWIAEDGLK IQTFGSQIWD TAFVLQVMLA ADVDDEIRPT LIKGYSYLRK SQFTENPPGD YINMFRDISK GGWGYSDKDQ GWPVSDCISE SLECCLIFES 501: MSSEFIGEKM EVERLYDAVN MLLYMQSRNG GISIWEAASG KKWLEWLSPI EFIEDTILEH EYLECTGSAI VVLARFMKQF PGHRTEEVKK FITKGVKYIE 601: SLQIADGSWY GNWGICFIYG TFFAVRGLVA AGNTYDNCEA IRRAVRFLLD IQNGEGGWGE SFLSCPNKNY IPLEGNKTDV VNTGQALMVL IMGGQMDRDP 701: LPVHRAAKVL INSQMDNGDF PQQEIRGVYK MNVMLNFPTF RNSFTLWALT HYTKAIRLLL |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)