AT5G27000.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.864 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : kinesin 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a kinesin-like protein that binds microtubules in an ATP-dependent manner. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
kinesin 4 (ATK4); FUNCTIONS IN: microtubule binding, protein binding, microtubule motor activity, ATPase activity; INVOLVED IN: microtubule-based movement; EXPRESSED IN: 13 plant structures; EXPRESSED DURING: 7 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Kinesin, motor region, conserved site (InterPro:IPR019821), Calponin-homology (InterPro:IPR016146), Calponin-like actin-binding (InterPro:IPR001715), Kinesin, motor domain (InterPro:IPR001752); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: P-loop nucleoside triphosphate hydrolases superfamily protein with CH (Calponin Homology) domain (TAIR:AT2G47500.1); Has 30201 Blast hits to 17322 proteins in 780 species: Archae - 12; Bacteria - 1396; Metazoa - 17338; Fungi - 3422; Plants - 5037; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2996 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:+:9498099..9502951 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 110015.00 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.92 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.62 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 987 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MATTSEINND LSFSVVSIVE DVLQQHSSRS SDVGLVSRKV EESSLRRYEA AGWLRDMIGV SNGKDFPGEP SEEEFRLGLR SGIVLCNVLN KVNPGSVSKV 101: VEAPDDVADG AALSAFQYFE NIRNFLVAIE EMGLPSFEAS DMEKGGKSIR IVNCILALKS YSEWKLKGEN GPWRYGSNMK HNFGSRKLFL RKSSEPFVSS 201: ISRTQSTDML STDQPLSSDG DSRSINGLVR SFIADRKHED IPNVVESVLN KVMEEVQQRL SIHNEMMKSS SKPIPEDDSS CETVVRSQLC DARQHEEAEE 301: NSPPQVVEKK FQRTNFEHHE EQKILLNQQK HIQELKQTLY TTKAGMKLLQ MKYQEDFFHL GKHLNGLAYA ATGYKRVLEE NRKLYNLVQD LKGNIRVYCR 401: VRPFLPGQES GGLSAVEDID EGTITIRVPS KYGKAGQKPF MFNKVFGPSA TQEEVFSDMQ PLVRSVLDGY NVCIFAYGQT GSGKTFTMTG PKELTEESLG 501: VNYRALADLF LLSNQRKDTT SYEISVQMLE IYNEQVRDLL AQDGQTKRLE IRNNSHNGIN VPEASLVPVS STDDVIQLMD LGHMNRAVSS TAMNDRSSRS 601: HSCVTVHVQG RDLTSGSILH GSMHLVDLAG SERVDKSEVT GDRLKEAQHI NKSLSALGDV ISSLSQKTSH VPYRNSKLTQ LLQDSLGGSA KTLMFVHISP 701: EPDTLGETIS TLKFAERVGS VELGAARVNK DNSEVKELKE QIANLKMALV RKGNGNDVQP TAIPINRERI SRRRSLETPT IRPKLPTMGN TSNNSRPQIM 801: DLSGPEAFND STASSRRHSL DIHELMKSSS PAWPRQPLNG KDEDRESKSG EWIDKHEELI QNQNPNSPEQ FYQSMVPQQQ SLYGGKQDFE VQSITDNESD 901: EAATSDCSDS DLLWRLSVQV NVPKVSNIQN SANPKPKKIQ PRTAKLSETR SLIPSLIPAP SKRPPNTVNS QPQRPTRDGK RRLSLGT |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)