AT5G24950.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:endoplasmic reticulum 0.984 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : cytochrome P450, family 71, subfamily A, polypeptide 15 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
putative cytochrome P450 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
cytochrome P450, family 71, subfamily A, polypeptide 15 (CYP71A15); FUNCTIONS IN: electron carrier activity, monooxygenase activity, iron ion binding, oxygen binding, heme binding; INVOLVED IN: oxidation reduction; LOCATED IN: endomembrane system; EXPRESSED IN: male gametophyte, cultured cell; EXPRESSED DURING: L mature pollen stage, M germinated pollen stage; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Cytochrome P450 (InterPro:IPR001128), Cytochrome P450, conserved site (InterPro:IPR017972), Cytochrome P450, E-class, group I (InterPro:IPR002401); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: cytochrome P450, family 71, subfamily A, polypeptide 14 (TAIR:AT5G24960.1); Has 1807 Blast hits to 1807 proteins in 277 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 736; Fungi - 347; Plants - 385; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 339 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:-:8595209..8597761 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 56359.80 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.36 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.09 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 496 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MEIIIISLCL ATILAFLLLK PLLNRTVAKD NLPPSPWRVP VIGNLHQLSL HPHRSLRSLS HRYGPLMLLH FGRVPILVVS SSDVAHDLMK THDLKVANRP 101: RLKVIETILN GGREVVFSPY GDYWRQIKTV CVVHLLNKKM VQSFAKVREE ERSVMMEKVE KASSDSSPLN LSKLLITLTS DVASRVSFGK KHSNEASMSD 201: FKNQVRKITE LVGGFPVSEY IPCLAWIDQI RGLYNRAEEV SKIFGDLMDK VVQEHLDATN KPTKDFVDIL LSFERQSKDG IEVRRSDIKF IILDIFLGGT 301: TTTNSLLEWT MTELIRHPEC MKKLQDEIRG DATNLTIYRS HEEVEDMKYL KAVIKEGLRL HPPFPLLVLR LLTQDVKLKG YDIAAGTQVI TNAWAIQRDI 401: VTWGIDAEEF RPERHLDSPL DFRGTNFEYI PFGSGRRICP GIGFAMALVE VTLANLVNRF NWRMDARLSG DEYDLAEATG IDVCRKFPLI VFPSNA |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)