AT5G22400.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 0.999 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Rho GTPase activating protein with PAK-box/P21-Rho-binding domain | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Rho GTPase activating protein with PAK-box/P21-Rho-binding domain; FUNCTIONS IN: Rac GTPase activator activity; INVOLVED IN: signal transduction; LOCATED IN: intracellular, chloroplast; EXPRESSED IN: 17 plant structures; EXPRESSED DURING: 7 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: PAK-box/P21-Rho-binding (InterPro:IPR000095), Rho GTPase activation protein (InterPro:IPR008936), RhoGAP (InterPro:IPR000198); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: rac GTPase activating protein (TAIR:AT3G11490.1); Has 3977 Blast hits to 3976 proteins in 184 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 2927; Fungi - 443; Plants - 206; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 401 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:-:7423050..7425335 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 51993.60 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 4.48 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.48 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 466 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MTEVLHFPSS PSASHSSSSS SSSPSPSSLS YASRSNATLL ISSDHNRRNP VARFDQDVDF HASIEEQDLR RRSSTDGGEE DDGGEDQISL LALLVAIFRR 101: SLISCKSNRR ELCSMEIGWP TNVRHVAHVT FDRFNGFLGL PVEFEPEVPR RAPSASATVF GVSTESMQLS YDSRGNCVPT ILLLMQNCLY SQGGLQAEGI 201: FRLTAENSEE EAVREQLNRG FIPERIDVHC LAGLIKAWFR ELPTSVLDSL SPEQVMQCQT EEENVELVRL LPPTEAALLD WAINLMADVV QYEHLNKMNS 301: RNIAMVFAPN MTQMDDPLTA LMYAVQVMNF LKTLIEKTLR ERQDSVVEQA HAFPLEPSDE SGHQSPSQSL AFNTSEQSEE TQSDNIENAE NQSSSSEISD 401: ELTLENNACE QRETDFGKYR TGRLSDSSQQ VVLNLDPPAQ WPVGRTKGLT NLSRVGSRVE RTEAWR |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)