AT5G22130.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:endoplasmic reticulum 1.000 ASURE: endoplasmic reticulum What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : mannosyltransferase family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
member of Glycosyltransferase Family- 50 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
PEANUT 1 (PNT1); FUNCTIONS IN: mannosyltransferase activity, transferase activity, transferring glycosyl groups, alpha-1,4-mannosyltransferase activity; INVOLVED IN: GPI anchor biosynthetic process, cellulose biosynthetic process, plant-type cell wall biogenesis, embryo development, cell division; LOCATED IN: integral to membrane, endoplasmic reticulum membrane; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Mannosyltransferase, DXD (InterPro:IPR007704); Has 30201 Blast hits to 17322 proteins in 780 species: Archae - 12; Bacteria - 1396; Metazoa - 17338; Fungi - 3422; Plants - 5037; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2996 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:-:7337486..7339831 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 52949.10 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.18 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.36 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 450 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MSRESENTDD EPSKWMKFRS LLVFSMLLRV FLIVYGEWQD AHMEVRYTDV DYIVFSDAAS LMASGESPYK RTTYRYSPLL ALLLTPNSFF HRSWGKFLFS 101: ASDLLVGWFI HKILKQRKVP EKICTYSVMV WLFNPFTFTI GTRGNCEPIV CAMILWIILC LMQGNLLQAA FWYGLVVHFR VYPIIYALPI ILVLDTQVFR 201: SGQKPALLYW NTGQAKTPAS NMERKTFLFN LLTTLKSLFS RERIMFALIS GGVFLACNAV SFYFYGQEFL HEALLYHLTR TDPRHNFSIY FYHIYLHYER 301: QFSAVEKLIS FLPQFTVQFA LVFCFSQDLV FCIFLQTVAF VTFNKVITAQ YFVWFYCLLP LILPWSHMKL KWEGLLCIIM WIGAQTHWLL WGYMLEFKGV 401: NVFLPLWIAS LLFLAANTFV LVRIIQRHRF SPLFRRYESS SSSNNVTKED |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)