AT5G20440.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:mitochondrion 0.473 cytosol 0.471 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Mob1/phocein family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Mob1/phocein family protein; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Mob1/phocein (InterPro:IPR005301); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Mob1/phocein family protein (TAIR:AT5G45550.1); Has 30201 Blast hits to 17322 proteins in 780 species: Archae - 12; Bacteria - 1396; Metazoa - 17338; Fungi - 3422; Plants - 5037; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2996 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:+:6908646..6909996 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 25236.30 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.79 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.32 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 216 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MGGFLVLNSS NNVVRTVPSK KRKHPEYKSK IRELISGIRS DNLREAVRLP QGVDINEWFA MNTVDFFNQI SLLYATLEEF CTQTTCPVMN AGRYEYRWAD 101: GTTITKPKTV SAPKYVEYLI DWVETEIDNE AIFPKNPGEP FPPNFEDFVK RILRKLFRVY AHIYYSHFHE IVALNEQAHL NTCFKHFLLF VSEFQLVDKE 201: KEMAPIKSLV ETMLDQ |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)