AT5G20430.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.981 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Mob1/phocein family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Mob1/phocein family protein; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Mob1/phocein (InterPro:IPR005301); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Mob1/phocein family protein (TAIR:AT5G20440.1); Has 1076 Blast hits to 1076 proteins in 202 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 549; Fungi - 273; Plants - 114; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 140 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:+:6904705..6905391 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 14643.80 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.16 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.33 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 122 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MKAGRYEYRW ADGTTMVSAP EYVELLMNWI ETQIDNEHIF PKKTGEPFPP NFEDFVKRIL RKLFRVYAHI YHSHFPKIVT LNEQAHLNTC FHRYLLFVSE 101: FQLVDKEEMV PIQKLVETIL KP |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)