AT5G18380.3
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.487 mitochondrion 0.439 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Ribosomal protein S5 domain 2-like superfamily protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Ribosomal protein S5 domain 2-like superfamily protein; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Ribosomal protein S5 domain 2-type fold (InterPro:IPR020568), Ribosomal protein S9 (InterPro:IPR000754), Ribosomal protein S9, conserved site (InterPro:IPR020574), Ribosomal protein S5 domain 2-type fold, subgroup (InterPro:IPR014721); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Ribosomal protein S5 domain 2-like superfamily protein (TAIR:AT2G09990.1). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:-:6090128..6090693 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 16055.00 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 10.38 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.09 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 139 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MATQPATESV QCFGRKKTAV AVTHCKRGSG LIKLNGCPIE LFQPEILRFK IFEPVLLLGK HRFAGVNMRI RVNGGGHTSQ VYAIRQSIAK ALVAYYQKYV 101: DEQSKKEIKD ILVRFFWEYG LVRLFRFYNF CFIMLVGLW |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)