AT5G18200.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 0.994 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : UTP:galactose-1-phosphate uridylyltransferases;ribose-5-phosphate adenylyltransferases | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
encodes an adenylyltransferase | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
UTP:galactose-1-phosphate uridylyltransferases;ribose-5-phosphate adenylyltransferases; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Galactose-1-phosphate uridyl transferase, N-terminal (InterPro:IPR005849), Histidine triad-like motif (InterPro:IPR011146), Galactose-1-phosphate uridyl transferase, class I (InterPro:IPR001937), Histidine triad motif (InterPro:IPR011151); Has 1807 Blast hits to 1807 proteins in 277 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 736; Fungi - 347; Plants - 385; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 339 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:+:6015270..6016555 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 39007.30 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.67 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.36 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 351 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MTSPSHASDR GGGDGDSVEN QSPELRKDPV TNRWVIFSPA RAKRPTDFKS KSPQNPNPKP SSCPFCIGRE QECAPELFRV PDHDPNWKLR VIENLYPALS 101: RNLETQSTQP ETGTSRTIVG FGFHDVVIES PVHSIQLSDI DPVGIGDILI AYKKRINQIA QHDSINYIQV FKNQGASAGA SMSHSHSQMM ALPVVPPTVS 201: SRLDGTKDYF EETGKCCLCE AKSKHFVIDE SSHFVSVAPF AATYPFEIWI IPKDHSSHFH HLDDVKAVDL GGLLKLMLQK IAKQLNDPPY NYMIHTSPLK 301: VTESQLPYTH WFLQIVPQLS GVGGFEIGTG CYINPVFPED VAKVMREVSL T |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)