AT5G17030.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 0.993 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : UDP-glucosyl transferase 78D3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
UDP-glucosyl transferase 78D3 (UGT78D3); FUNCTIONS IN: quercetin 3-O-glucosyltransferase activity, UDP-glycosyltransferase activity, flavonol 3-O-arabinosyltransferase activity, transferase activity, transferring glycosyl groups; INVOLVED IN: metabolic process; EXPRESSED IN: 8 plant structures; EXPRESSED DURING: 4 anthesis, F mature embryo stage, petal differentiation and expansion stage, E expanded cotyledon stage, D bilateral stage; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase (InterPro:IPR002213); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: UDP-glucosyl transferase 78D2 (TAIR:AT5G17050.1); Has 1807 Blast hits to 1807 proteins in 277 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 736; Fungi - 347; Plants - 385; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 339 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:-:5603198..5604723 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 49969.70 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.20 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.02 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 459 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAKPSQPTRD SHVAVLVFPF GTHAAPLLAV TCRLATAAPS TVFSFFSTAR SNSSLLSSDI PTNIRVHNVD DGVPEGFVLT GNPQHAVELF LEAAPEIFRR 101: EIKAAETEVG RKFKCILTDA FLWLAAETAA AEMKASWVAY YGGGATSLTA HLYTDAIREN VGVKEVGERM EETIGFISGM EKIRVKDTQE GVVFGNLDSV 201: FSKTLHQMGL ALPRATAVFI NSFEELDPTF TNDFRSEFKR YLNIGPLALL SSPSQTSTLV HDPHGCLAWI EKRSTASVAY IAFGRVATPP PVELVAIAQG 301: LESSKVPFVW SLQEMKMTHL PEGFLDRTRE QGMVVPWAPQ VELLNHEAMG VFVSHGGWNS VLESVSAGVP MICRPIFGDH AINARSVEAV WEIGVTISSG 401: VFTKDGFEES LDRVLVQDDG KKMKVNAKKL EELAQEAVST KGSSFENFGG LLDEVVNFG |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)