AT5G15730.2
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 0.991 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Protein kinase superfamily protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Protein kinase superfamily protein; FUNCTIONS IN: protein serine/threonine kinase activity, protein kinase activity, kinase activity, ATP binding; INVOLVED IN: protein amino acid phosphorylation; LOCATED IN: endomembrane system; EXPRESSED IN: 23 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR000719), Serine/threonine-protein kinase-like domain (InterPro:IPR017442), Protein kinase-like domain (InterPro:IPR011009), Serine/threonine-protein kinase, active site (InterPro:IPR008271); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Protein kinase superfamily protein (TAIR:AT5G54590.2); Has 117437 Blast hits to 116208 proteins in 4662 species: Archae - 111; Bacteria - 12502; Metazoa - 44353; Fungi - 9876; Plants - 32963; Viruses - 432; Other Eukaryotes - 17200 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:+:5131284..5133046 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 48763.60 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.43 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.34 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 436 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MVNRSDLVVI GISVGLALGL LLALLLFFAI KWYYGRSHLR RCANEQNSPT LPVHTAKRGV VIPDDRANTE SSQPPENGAP TQHQPWWNNH TKDLTVSASG 101: IPRYNYKDIQ KATQNFTTVL GQGSFGPVYK AVMPNGELAA AKVHGSNSSQ GDREFQTEVS LLGRLHHRNL VNLTGYCVDK SHRMLIYEFM SNGSLENLLY 201: GGEGMQVLNW EERLQIALDI SHGIEYLHEG AVPPVIHRDL KSANILLDHS MRAKVADFGL SKEMVLDRMT SGLKGTHGYM DPTYISTNKY TMKSDIYSFG 301: VIILELITAI HPQQNLMEYI NLASMSPDGI DEILDQKLVG NASIEEVRLL AKIANRCVHK TPRKRPSIGE VTQFILKIKQ SRSRGRRQDT MSSSFGVGYE 401: EDLSRVMSRI KDQHVELGLL AGVKEENHQE RNIATT |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)