AT5G15380.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 1.000 ASURE: nucleus What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : domains rearranged methylase 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes methyltransferase involved in the de novo DNA methylation and maintenance of asymmetric methylation of DNA sequences. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
domains rearranged methylase 1 (DRM1); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Ubiquitin-associated/translation elongation factor EF1B, N-terminal, eukaryote (InterPro:IPR015940), DNA methylase, C-5 cytosine-specific (InterPro:IPR001525); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: domains rearranged methyltransferase 2 (TAIR:AT5G14620.1); Has 662 Blast hits to 554 proteins in 116 species: Archae - 0; Bacteria - 110; Metazoa - 281; Fungi - 2; Plants - 156; Viruses - 12; Other Eukaryotes - 101 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:+:4991347..4994826 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 70922.00 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 4.97 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.47 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 624 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MVMSHIFLIS QIQEVEHGDS DDVNWNTDDD ELAIDNFQFS PSPVHISATS PNSIQNRISD ETVASFVEMG FSTQMIARAI EETAGANMEP MMILETLFNY 101: SASTEASSSK SKVINHFIAM GFPEEHVIKA MQEHGDEDVG EITNALLTYA EVDKLRESED MNININDDDD DNLYSLSSDD EEDELNNSSN EDRILQALIK 201: MGYLREDAAI AIERCGEDAS MEEVVDFICA AQMARQFDEI YAEPDKKELM NNNKKRRTYT ETPRKPNTDQ LISLPKEMIG FGVPNHPGLM MHRPVPIPDI 301: ARGPPFFYYE NVAMTPKGVW AKISSHLYDI VPEFVDSKHF CAAARKRGYI HNLPIQNRFQ IQPPQHNTIQ EAFPLTKRWW PSWDGRTKLN CLLTCIASSR 401: LTEKIREALE RYDGETPLDV QKWVMYECKK WNLVWVGKNK LAPLDADEME KLLGFPRDHT RGGGISTTDR YKSLGNSFQV DTVAYHLSVL KPLFPNGINV 501: LSLFTGIGGG EVALHRLQIK MNVVVSVEIS DANRNILRSF WEQTNQKGIL REFKDVQKLD DNTIERLMDE YGGFDLVIGG SPCNNLAGGN RHHRVGLGGE 601: HSSLFFDYCR ILEAVRRKAR HMRR |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)