AT5G14800.2
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.930 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : pyrroline-5- carboxylate (P5C) reductase | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Delta 1-pyrroline-5-carboxylate reductase, catalyzes the final step in proline biosynthesis from glutamate and ornithine.In situ hybridization indicated that under normal growth conditions, the highest concentration of P5CR transcripts occurs in the cortical parenchyma, phloem, vascular cambium and pith parenchyma in the vicinity of the protoxylem. Single gene in Arabidopsis. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
pyrroline-5- carboxylate (P5C) reductase (P5CR); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent (InterPro:IPR004455), NAD(P)-binding domain (InterPro:IPR016040), Delta 1-pyrroline-5-carboxylate reductase (InterPro:IPR000304); Has 7429 Blast hits to 7426 proteins in 2378 species: Archae - 102; Bacteria - 5104; Metazoa - 368; Fungi - 229; Plants - 70; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 1556 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:-:4786353..4787618 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 23244.10 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.07 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.29 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 223 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MEILPIPAES FKVGFIGAGK MAESIARGVV ASGVLPPNRI CTAVHSNLNR RDVFESFGVN VFSTSEEVVK ESDVVIFSVK PQVVKKAVTE LKSKLSKNKI 101: LVSVAAGIKL NDLQEWSGQD RFIRVMPNTP AAVGEAASVM SLGTGATEED GAIVAMLFGA VGKILKADEK MFDAVTGLSG SGPAYIFLAI EALADGGVAA 201: GLPRELALSL ASQTVSSWSC NDG |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)