AT5G14570.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 0.500 vacuole 0.500 ASURE: plasma membrane,vacuole What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : high affinity nitrate transporter 2.7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes ATNRT2.7, a nitrate transporter that controls nitrate content in seeds. Expression is detected in reproductive organs and peaks in seeds. Localized to the vacuolar membrane. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
high affinity nitrate transporter 2.7 (NRT2.7); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Major facilitator superfamily (InterPro:IPR020846), Major facilitator superfamily MFS-1 (InterPro:IPR011701), Major facilitator superfamily, general substrate transporter (InterPro:IPR016196); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: nitrate transporter2.5 (TAIR:AT1G12940.1); Has 7777 Blast hits to 7739 proteins in 1625 species: Archae - 132; Bacteria - 6743; Metazoa - 43; Fungi - 326; Plants - 261; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 272 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:-:4695331..4696890 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 52680.60 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.20 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.50 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 493 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MEPSQRNTKP PSFSDSTIPV DSDGRATVFR PFSLSSPHSR AFHLAWLSLF SCFFSTFSIP PLVPVISSDL NLSASTVSAA GIASFAGSIF SRLAMGPLCD 101: LIGPRTSSAI LSFLTAPVIL SASLVSSPTS FILVRFFVGF SLANFVANQY WMSSMFSGNV IGLANGVSAG WANVGAGISQ LLMPLIYSTI AEFLPRAVAW 201: RVSFVFPAIF QVTTAVLVLL YGQDTPHGNR KNSNQNKLTI PEEEEVLVVE EDERSSFVEI LIGGLGNYRA WILALLYGYS YGVELTTDNV IAGYFYERFG 301: VNLEAAGTIA ASFGISNIAS RPAGGMISDA LGKRFGMRGR LWGLWIVQSV AGLLCVLLGR VNSLWGSILV MWVFSVFVQA ASGLVFGVVP FVSTRSLGVV 401: AGITGSGGTV GAVVTQFLLF SGDDVRKQRS ISLMGLMTFV FALSVTSIYF PQWGGMCCGP SSSSEEEDIS RGLLVEDEDE EGKVVSGSLR PVC |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)