AT5G12380.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.997 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : annexin 8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
annexin 8 (ANNAT8); FUNCTIONS IN: calcium-dependent phospholipid binding, calcium ion binding; INVOLVED IN: response to water deprivation, response to salt stress, response to cold, response to heat; EXPRESSED IN: embryo, pedicel, synergid; EXPRESSED DURING: 4 anthesis, C globular stage; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Annexin like protein (InterPro:IPR015472), Annexin repeat (InterPro:IPR018502), Annexin repeat, conserved site (InterPro:IPR018252), Annexin (InterPro:IPR001464), Annexin, type plant (InterPro:IPR009118); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: annexin 7 (TAIR:AT5G10230.1); Has 30201 Blast hits to 17322 proteins in 780 species: Archae - 12; Bacteria - 1396; Metazoa - 17338; Fungi - 3422; Plants - 5037; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2996 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:+:4009223..4010687 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 35764.00 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.79 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.25 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 316 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MATIVSPPHF SPVEDAENIK AACQGWGTNE NAIISILGHR NLFQRKLIRQ AYQEIYHEDL IHQLKSELSG NFERAICLWV LDPPERDALL ANLALQKPIP 101: DYKVLVEIAC MRSPEDMLAA RRAYRCLYKH SLEEDLASRT IGDIRRLLVA MVSAYKYDGE EIDEMLAQSE AAILHDEILG KAVDHEETIR VLSTRSSMQL 201: SAIFNRYKDI YGTSITKDLL NHPTNEYLSA LRAAIRCIKN PTRYYAKVLR NSINTVGTDE DALNRVIVTR AEKDLTNITG LYFKRNNVSL DQAIAKETSG 301: DYKAFLLALL GHGKQL |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)