AT5G11320.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.634 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Flavin-binding monooxygenase family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Belongs to the YUC gene family. Encodes a predicted flavin monooxygenase YUC4 involved in auxin biosynthesis and plant development. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
YUCCA4 (YUC4); FUNCTIONS IN: NADP or NADPH binding, oxidoreductase activity, monooxygenase activity, FAD binding, flavin-containing monooxygenase activity; INVOLVED IN: in 7 processes; EXPRESSED IN: 12 plant structures; EXPRESSED DURING: 6 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, class-II (InterPro:IPR000103), FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase (InterPro:IPR013027), Flavin-containing monooxygenase-like (InterPro:IPR020946); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Flavin-binding monooxygenase family protein (TAIR:AT4G32540.1); Has 1807 Blast hits to 1807 proteins in 277 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 736; Fungi - 347; Plants - 385; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 339 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:-:3611429..3613361 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 45408.20 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.89 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.08 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 411 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MGTCRESEPT QIFVPGPIIV GAGPSGLAVA ACLSNRGVPS VILERTDCLA SLWQKRTYDR LKLHLPKHFC ELPLMPFPKN FPKYPSKQLF ISYVESYAAR 101: FNIKPVFNQT VEKAEFDDAS GLWNVKTQDG VYTSTWLVVA TGENAEPVFP NIPGLKKFTG PVVHTSAYKS GSAFANRKVL VVGCGNSGME VSLDLCRYNA 201: LPHMVVRNSV HVLPRDFFGL STFGIAMTLL KWFPLKLVDK FLLLLANSTL GNTDLLGLRR PKTGPIELKN VTGKTPVLDV GAISLIRSGQ IKVTQAVKEI 301: TRNGAKFLNG KEIEFDSIIL ATGYKSNVPD WLKENSFFTK EGMPKTPFPN GWKGEKGLYT VGFTRRGLSG TAYDAVKIAE DITDQWMKFN GPLSCRNICS 401: SHIIHLHFNK S |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)