AT5G10240.2
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : asparagine synthetase 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes asparagine synthetase (ASN3). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
asparagine synthetase 3 (ASN3); FUNCTIONS IN: asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing) activity; INVOLVED IN: asparagine biosynthetic process; EXPRESSED IN: 23 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Rossmann-like alpha/beta/alpha sandwich fold (InterPro:IPR014729), Asparagine synthase (InterPro:IPR001962), Asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing (InterPro:IPR006426), Glutamine amidotransferase, type II (InterPro:IPR017932); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: asparagine synthetase 2 (TAIR:AT5G65010.1); Has 13137 Blast hits to 12731 proteins in 2385 species: Archae - 388; Bacteria - 8359; Metazoa - 215; Fungi - 297; Plants - 415; Viruses - 9; Other Eukaryotes - 3454 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:-:3212934..3216418 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 65036.50 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.79 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.32 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 577 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MCGILAVLGC VDNSQAKRSR IIELSRRLRH RGPDWSGLHC YEDCYLAHER LAIVDPTSGD QPLYNEDKTI AVTVNGEIYN HKALRENLKS HQFRTGSDCE 101: VIAHLVKHGE EFVDMLDGMF AFVLLDTRDK SFIAARDAIG ITPLYIGWGL DGSVWFASEM KALSDDCEQF MCFPPGHIYS SKQGGLRRWY NPPWFSEVVP 201: STPYDPLVVR NTFEKAVIKR LMTDVPFGVL LSGGLDSSLV ASVALRHLEK SEAACQWGSK LHTFCIGLKG SPDLKAGREV ADYLGTRHHE LHFTVQDGID 301: AIEEVIYHVE TYDVTTIRAS TPMFLMSRKI KSLGVKMVLS GEGSDEIFGG YLYFHKAPNK KEFHEETCRK IKALHQYDCL RANKSTSAWG VEARVPFLDK 401: EFINVAMSID PEWKMIRPDL GRIEKWVLRN AFDDEKNPYL PKHILYRQKE QFSDGVGYSW IDGLKDHANK HVSETMLMNA SFVFPDNTPL TKEAYYYRTI 501: FEKFFPKSAA RATVPGGPSV ACSTAKAVEW DAAWSQNLDP SGRAALGVHV SAYGEDKTED SRPEKLQKLA EKTPAIV |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)