AT5G10220.1
|
Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.998 What is SUBAcon? |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Experimental Localisations and PPI |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Description (TAIR10) | protein_coding : annexin 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a calcium-binding protein annexin (AnnAt6). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
annexin 6 (ANN6); FUNCTIONS IN: calcium-dependent phospholipid binding, calcium ion binding; INVOLVED IN: response to red or far red light, response to water deprivation, response to salt stress, response to cold, response to heat; LOCATED IN: cellular_component unknown; EXPRESSED IN: flower; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Annexin like protein (InterPro:IPR015472), Annexin repeat (InterPro:IPR018502), Annexin repeat, conserved site (InterPro:IPR018252), Annexin (InterPro:IPR001464), Annexin, type plant (InterPro:IPR009118); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: annexin 7 (TAIR:AT5G10230.1); Has 1807 Blast hits to 1807 proteins in 277 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 736; Fungi - 347; Plants - 385; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 339 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Coordinates (TAIR10) | chr5:-:3206980..3208784 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 36571.70 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.19 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.48 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 318 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MASLKIPANI PLPEEDSEQL HKAFKGWGTN EGMIISILAH RNATQRSFIR AVYAANYNKD LLKELDGELS GDFERVVMLW TLDPTERDAY LANESTKLFT 101: KNIWVLVEIA CTRPSLEFFK TKQAYHVRYK TSLEEDVAYH TSGNIRKLLV PLVSTFRYDG NADEVNVKLA RSEAKTLHKK ITEKAYTDED LIRILTTRSK 201: AQINATLNHF KDKFGSSINK FLKEDSNDDY VQLLKTAIKC LTYPEKYFEK VLRRAINRMG TDEWALTRVV TTRAEVDLER IKEEYLRRNS VPLDRAIAND 301: TSGDYKDMLL ALLGHDHA |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| See Also |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)