AT5G10140.4
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : K-box region and MADS-box transcription factor family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
FLOWERING LOCUS C (FLC); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Transcription factor, MADS-box (InterPro:IPR002100), Transcription factor, K-box (InterPro:IPR002487); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: AGAMOUS-like 31 (TAIR:AT5G65050.1). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:-:3173724..3179339 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 20237.50 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.98 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.35 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 182 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MGRKKLEIKR IENKSSRQVT FSKRRNGLIE KARQLSVLCD ASVALLVVSA SGKLYSFSSG DNLVKILDRY GKQHADDLKA LDHQSKALNY GSHYELLELV 101: DSKLVGSNVK NVSIDALVQL EEHLETALSV TRAKKTELML KLVENLKEKM ENNHHVGAEA EMEMSPAGQI SDNLPVTLPL LN |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)