AT5G09690.2
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.997 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : magnesium transporter 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Transmembrane magnesium transporter. One of nine family members. Loss of function mutants exhibit poor growth under magnesium stress conditions. Splice variant AT5G09690.1 (386 aa) is a functional transporter while AT5G09690.4 (371 aa) does not have transporter activity. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
magnesium transporter 7 (MGT7); FUNCTIONS IN: magnesium ion transmembrane transporter activity, metal ion transmembrane transporter activity; INVOLVED IN: metal ion transport, transmembrane transport; LOCATED IN: membrane; EXPRESSED IN: 31 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Mg2+ transporter protein, CorA-like (InterPro:IPR002523); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: magnesium transporter 9 (TAIR:AT5G64560.1); Has 35333 Blast hits to 34131 proteins in 2444 species: Archae - 798; Bacteria - 22429; Metazoa - 974; Fungi - 991; Plants - 531; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 9610 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:-:3000990..3003415 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 44567.40 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 4.52 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.06 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 397 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MALGLSSEES EMSPDGELVP VDSSAVVTAK RKTSQLSRSW ISIDATGQKT VLDVDKHVIM HRVQIHARDL RILDPNLFYP SAILGRERAI VLNLEHIKAI 101: ITAEEVLIRD SSDENVIPVL EEFQRRLPVG NEAHGVHGDG DLGEEDESPF EFRALEVALE AICSFLAART TELEKFAYPA LDELTLKISS RNLERVRKLK 201: SAMTRLTARV QKVRDELEQL LDDDGDMADL YLTRKLVGAS SSVSVSDEPI WYPTSPTIGS MISRASRVSL VTVRGDDETD VEELEMLLEA YFMQIDSTLN 301: KLTELREYID DTEDYINIQL DNHRNQLIQL ELMLSAGTVC VSVYSMIAGI FGMNIPNTWN HDHGYIFKWV VSLTGTFCIV LFVIILSYAR FRGLIGS |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)