AT5G09490.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 1.000 ASURE: cytosol What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Ribosomal protein S19 family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Ribosomal protein S19 family protein; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Ribosomal protein S15, eukaryotic/archaeal (InterPro:IPR005713), Ribosomal protein S19/S15 (InterPro:IPR002222), Ribosomal protein S19 conserved site (InterPro:IPR020934); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Ribosomal protein S19 family protein (TAIR:AT5G09500.1); Has 9411 Blast hits to 9411 proteins in 3582 species: Archae - 256; Bacteria - 4896; Metazoa - 280; Fungi - 237; Plants - 1722; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2020 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:-:2952378..2953183 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 17141.30 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 10.83 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.30 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 152 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAEVEPDVSA AALAKKRTFK KFSFKGVDLD ALLDMPTDDL VELFPSRIRR RMSRGLTRKP MALIKKLRKA KLDAPAGEKP EVVRTHLRNM VIMPEMIGSI 101: IGVYNGKTFN QIEIKPEMIG HYLAEFSITY KPVRHGKPGH GATHSSRFIP LK |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)