AT5G08100.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : N-terminal nucleophile aminohydrolases (Ntn hydrolases) superfamily protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
N-terminal nucleophile aminohydrolases (Ntn hydrolases) superfamily protein; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Peptidase T2, asparaginase 2 (InterPro:IPR000246); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: N-terminal nucleophile aminohydrolases (Ntn hydrolases) superfamily protein (TAIR:AT3G16150.1); Has 3243 Blast hits to 3196 proteins in 873 species: Archae - 113; Bacteria - 1502; Metazoa - 516; Fungi - 215; Plants - 193; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 704 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:-:2593242..2594586 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 33029.40 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.18 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.00 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 315 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MVGWAIALHG GAGDIPIDLP DERRIPRESA LRHCLDLGIS ALKSGKPPLD VAELVVRELE NHPDFNAGKG SVLTAQGTVE MEASIMDGKT KRCGAVSGLT 101: TVVNPISLAR LVMEKTPHIY LAFDAAEAFA RAHGVETVDS SHFITPENIA RLKQAKEFNR VQLDYTVPSP KVPDNCGDSQ IGTVGCVAVD SAGNLASATS 201: TGGYVNKMVG RIGDTPVIGA GTYANHLCAI SATGKGEDII RGTVARDVAA LMEYKGLSLT EAAAYVVDQS VPRGSCGLVA VSANGEVTMP FNTTGMFRAC 301: ASEDGYSEIA IWPNN |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)