AT5G06780.2
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 0.799 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Emsy N Terminus (ENT)/ plant Tudor-like domains-containing protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Emsy N Terminus (ENT)/ plant Tudor-like domains-containing protein; FUNCTIONS IN: molecular_function unknown; INVOLVED IN: biological_process unknown; LOCATED IN: cellular_component unknown; EXPRESSED IN: 22 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Tudor-like, plant (InterPro:IPR014002), ENT (InterPro:IPR005491); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Emsy N Terminus (ENT)/ plant Tudor-like domains-containing protein (TAIR:AT3G12140.2). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:-:2094147..2096356 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 35588.30 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.15 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.86 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 313 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MEAQIHILEQ EAYSAVLRAF QAQADEFSWD KATVMTNLRK ELRISDDENR QLLNNVHNDD LIKRIRDSRP RGGNQVVRHQ SLDVHPSPTF SASRKKQKTF 101: QSYPSIGSTR SKSFNNRVVS ANEPAEALIG RKVWTKWPED NSFYEAVVTQ YNANEGRHAL VYDINTVNET WEWVDLNEIP TKDIRWDGEE DGVTLNVGHG 201: GGTTRGNRRT LSHGGRGRGP RTQPRREHLA TENGGGRKFF GEIELFNTDS LVKEVERVFD SNLPDPHELD KAKKLLKEHE QALIAAIARL TDASDYESDG 301: EEPYSHELPM LLG |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)