AT5G04330.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 0.853 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Cytochrome P450 superfamily protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Cytochrome P450 superfamily protein; FUNCTIONS IN: electron carrier activity, monooxygenase activity, iron ion binding, oxygen binding, heme binding; INVOLVED IN: oxidation reduction; LOCATED IN: endomembrane system; EXPRESSED IN: 10 plant structures; EXPRESSED DURING: 7 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Cytochrome P450 (InterPro:IPR001128), Cytochrome P450, E-class, group I (InterPro:IPR002401), Cytochrome P450, conserved site (InterPro:IPR017972); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: ferulic acid 5-hydroxylase 1 (TAIR:AT4G36220.1); Has 34679 Blast hits to 34410 proteins in 1775 species: Archae - 74; Bacteria - 4291; Metazoa - 12124; Fungi - 7284; Plants - 9486; Viruses - 6; Other Eukaryotes - 1414 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:-:1212695..1214310 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 57958.60 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.20 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.02 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 512 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MLTLMTLIVL VPLLLFLFPH LLLRRQMLLK PYPPGPKGLP VIGNILMMNQ FNHRGLAKLS RIYGGLLHLR LGFSHIFVVS SPDIARQVLQ VQDHVFSNRP 101: TTIAIRYLTY GGSDLAFCNY GPFWRRMRKL YVMMLFSRKR AESWVSVDEE VHKSVRLVAS NVGKPLNICK LAFSLSRDIT FRAAFGSSSS TSDESRLDEF 201: LEIIQEFSKL FGEFNVADYV PSWLSWIDPQ GINGRVEKAR KSLDGFIESV IDDHLHKKKR EHDNVDEETD MVDQLLAFYE EEVKVNNSVT KINLDNIKGI 301: IMDVMFGGTE TVALAIEWVL TEILRSPENM KRVQDELTSV VGLDRWRVED THLEKLTFLK CILKETLRLH PPFPLLLHET VKDTEISGYF IPKGSRVMVN 401: TYALGRDPNS WSDPESFNPG RFLNPIAPDL KGNNFEFVPF GSGRRSCPGM QLGLYAFELA VAHLLHCFTW SLPDGMNPGD VDTVEGPGLT VPKAIPLVAV 501: PTTRLLCPIV VS |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)