AT4G39650.1
Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min: :max .
SUBAcon:extracellular 1.000 What is SUBAcon? |
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Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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Description (TAIR10) | protein_coding : gamma-glutamyl transpeptidase 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Curator Summary (TAIR10) |
The gene encodes a gamma-glutamyltransferase (AKA gamma-glutamyl transpeptidase, EC 2.3.2.2) that is located in the apoplast of young siliques (within the ovules of the carpel) and is involved in the degradation of glutathione. The encoded enzyme also acts as part of a GSH pumping gamma-glutamyl cycle in this tissue and may also be involved in gamma-glutamyl amino acid formation. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Computational Description (TAIR10) |
gamma-glutamyl transpeptidase 2 (GGT2); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Gamma-glutamyltranspeptidase (InterPro:IPR000101); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: gamma-glutamyl transpeptidase 1 (TAIR:AT4G39640.2); Has 9214 Blast hits to 9192 proteins in 1483 species: Archae - 86; Bacteria - 4248; Metazoa - 714; Fungi - 303; Plants - 110; Viruses - 1; Other Eukaryotes - 3752 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Annotations |
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Coordinates (TAIR10) | chr4:+:18403602..18405914 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Weight (calculated) | 61603.30 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IEP (calculated) | 8.36 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GRAVY (calculated) | -0.06 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Length | 578 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MNSFMSLVRT ATIALLLIAF LQNANAVKNL QSIVAYHGAV ATDDGRCSAI GTNVLRQGGN AIDASVAAAL CLGVVSPASS GIGGGAFTMI KLANGTEVAY 101: DSRETAPLSA TEDMYGDNPE RKKKGSLSVG VPGEVAGLYT AWTQHGKLPW KQLVEPAEKL AAEGFKISKY LYMQMNATRS DILADKGLSE LFVSNGELKK 201: PGAICRNPKL ADTLSQIAEY GPKAFYNGTV GFNLVSDIQK AGGIITLKDL QNYNVKVKEP LSTEILGYRL LGMPPPSSGG PAMMLILNIL AQYGIPSGVS 301: GPLGVHRLVE ALKHAFAVRM NLGDPDFVPE VTNVVADMLS PKFAQDLKSK INDEKTFDPK YYGGKWGQIK DHGTSHLSII DSERNAVSMT STINGYFGAI 401: MLSPSTGIVL NNEMDDFSIP TKSGGDPDVP PPAPANFIRP GKRPLSSMTP TIVLKDGKVK AALGASGGMY IIAGTTQVYL NHFFLNMDPL SSVVAPRIYH 501: QLIPNKASYE NWTTVYSDHF EIPEEIRLVL EKKGQVLTPI AGGTISQLIV EQSDGKSGGI SKLVAVSDPR KGGFPSGY |
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See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)