AT4G38830.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : cysteine-rich RLK (RECEPTOR-like protein kinase) 26 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a cysteine-rich receptor-like protein kinase. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
cysteine-rich RLK (RECEPTOR-like protein kinase) 26 (CRK26); FUNCTIONS IN: kinase activity; INVOLVED IN: protein amino acid phosphorylation; LOCATED IN: endomembrane system; EXPRESSED IN: stem, root; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein kinase, ATP binding site (InterPro:IPR017441), Serine/threonine-protein kinase domain (InterPro:IPR002290), Protein of unknown function DUF26 (InterPro:IPR002902), Serine/threonine-protein kinase-like domain (InterPro:IPR017442), Protein kinase-like domain (InterPro:IPR011009), Serine/threonine-protein kinase, active site (InterPro:IPR008271), Protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR000719), Tyrosine-protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR020635); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: cysteine-rich RLK (RECEPTOR-like protein kinase) 29 (TAIR:AT4G21410.1); Has 124218 Blast hits to 122701 proteins in 4579 species: Archae - 106; Bacteria - 13898; Metazoa - 45472; Fungi - 10958; Plants - 35042; Viruses - 435; Other Eukaryotes - 18307 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:+:18122339..18124943 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 74359.50 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.26 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.15 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 665 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MLSLLLPLIS LLFQIQCFTV KSQPVPLNQI CSNVTGNFTV NTPYAVNLDR LISSLSSLRR NVNGFYNISV GDSDEKVNSI SQCRGDVKLE VCINCIAMAG 101: KRLVTLCPVQ KEAIIWYDKC TFRYSNRTIF NRLEISPHTS ITGTRNFTGD RDSWEKSLRG LLEGLKNRAS VIGRSKKNFV VGETSGPSFQ TLFGLVQCTP 201: DISEEDCSYC LSQGIAKIPS CCDMKMGSYV MSPSCMLAYA PWRFYDPVDT DDPSSVPATP SRPPKNETRS VTQGDKNRGV PKALIFASAS VAIVVLFIVL 301: LVVFLKLRRK ENIRNSENKH ENENISTDSM KFDFSVLQDA TSHFSLENKL GEGGFGAVYK GVLSDGQKIA VKRLSKNAQQ GETEFKNEFL LVAKLQHRNL 401: VKLLGYSIEG TERLLVYEFL PHTSLDKFIF DPIQGNELEW EIRYKIIGGV ARGLLYLHQD SRLRIIHRDL KASNILLDEE MTPKIADFGM ARLFDIDHTT 501: QRYTNRIVGT FGYMAPEYVM HGQFSFKTDV YSFGVLVLEI ISGKKNSGFS SEDSMGDLIS FAWRNWKEGV ALNLVDKILM TMSSYSSNMI MRCINIGLLC 601: VQEKVAERPS MASVVLMLDG HTIALSEPSK PAFFSHSNAV SDSSSSLGHN AKTSNYNSNT ELYPR |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)