AT4G37490.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : CYCLIN B1;1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Cyclin-dependent protein kinase CYCB1;1. Functions as an effector of growth control at G2/M. Regulated by TCP20. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
CYCLIN B1;1 (CYCB1;1); FUNCTIONS IN: cyclin-dependent protein kinase regulator activity; INVOLVED IN: regulation of cell cycle, regulation of cell growth, response to gamma radiation; LOCATED IN: nucleus; EXPRESSED IN: 17 plant structures; EXPRESSED DURING: 8 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Cyclin, C-terminal (InterPro:IPR004367), Cyclin-like (InterPro:IPR011028), Cyclin-related (InterPro:IPR013763), Cyclin, N-terminal (InterPro:IPR006671), Cyclin, A/B/D/E (InterPro:IPR014400), Cyclin (InterPro:IPR006670); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Cyclin family protein (TAIR:AT5G06150.1); Has 4378 Blast hits to 4375 proteins in 374 species: Archae - 0; Bacteria - 2; Metazoa - 1992; Fungi - 556; Plants - 1161; Viruses - 34; Other Eukaryotes - 633 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:-:17622129..17624208 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 48462.40 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.78 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.37 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 428 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MMTSRSIVPQ QSTDDVVVVD GKNVAKGRNR QVLGDIGNVV RGNYPKNNEP EKINHRPRTR SQNPTLLVED NLKKPVVKRN AVPKPKKVAG KPKVVDVIEI 101: SSDSDEELGL VAAREKKATK KKATTYTSVL TARSKAACGL EKKQKEKIVD IDSADVENDL AAVEYVEDIY SFYKSVESEW RPRDYMASQP DINEKMRLIL 201: VEWLIDVHVR FELNPETFYL TVNILDRFLS VKPVPRKELQ LVGLSALLMS AKYEEIWPPQ VEDLVDIADH AYSHKQILVM EKTILSTLEW YLTVPTHYVF 301: LARFIKASIA DEKMENMVHY LAELGVMHYD TMIMFSPSMV AASAIYAARS SLRQVPIWTS TLKHHTGYSE TQLMDCAKLL AYQQWKQQEE GSESSTKGAL 401: RKKYSKDERF AVALIPPAKA LLTGTESA |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)