AT4G37430.1
Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min: :max .
SUBAcon:endoplasmic reticulum 1.000 What is SUBAcon? |
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Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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Description (TAIR10) | protein_coding : cytochrome P450, family 91, subfamily A, polypeptide 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a member of the CYP81F cytochrome P450 monooxygenase subfamily. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Computational Description (TAIR10) |
cytochrome P450, family 91, subfamily A, polypeptide 2 (CYP91A2); FUNCTIONS IN: electron carrier activity, monooxygenase activity, iron ion binding, oxygen binding, heme binding; INVOLVED IN: oxidation reduction; LOCATED IN: endoplasmic reticulum; EXPRESSED IN: 16 plant structures; EXPRESSED DURING: 6 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Cytochrome P450 (InterPro:IPR001128), Cytochrome P450, E-class, group I (InterPro:IPR002401), Cytochrome P450, conserved site (InterPro:IPR017972); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: cytochrome P450, family 81, subfamily F, polypeptide 3 (TAIR:AT4G37400.1); Has 35359 Blast hits to 35102 proteins in 1807 species: Archae - 61; Bacteria - 5194; Metazoa - 11886; Fungi - 7177; Plants - 9569; Viruses - 6; Other Eukaryotes - 1466 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Annotations |
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Coordinates (TAIR10) | chr4:+:17597242..17598829 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Weight (calculated) | 57558.90 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IEP (calculated) | 8.11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GRAVY (calculated) | -0.31 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Length | 500 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MLYFILLPLL FLVISYKFLY SKTQRFNLPP GPPSRPFVGH LHLMKPPIHR LLQRYSNQYG PIFSLRFGSR RVVVITSPSL AQESFTGQND IVLSSRPLQL 101: TAKYVAYNHT TVGTAPYGDH WRNLRRICSQ EILSSHRLIN FQHIRKDEIL RMLTRLSRYT QTSNESNDFT HIELEPLLSD LTFNNIVRMV TGKRYYGDDV 201: NNKEEAELFK KLVYDIAMYS GANHSADYLP ILKLFGNKFE KEVKAIGKSM DDILQRLLDE CRRDKEGNTM VNHLISLQQQ QPEYYTDVII KGLMMSMMLA 301: GTETSAVTLE WAMANLLRNP EVLEKARSEI DEKIGKDRLI DESDIAVLPY LQNVVSETFR LFPVAPFLIP RSPTDDMKIG GYDVPRDTIV MVNAWAIHRD 401: PEIWEEPEKF NPDRYNDGCG SDYYVYKLMP FGNGRRTCPG AGLGQRIVTL ALGSLIQCFE WENVKGEEMD MSESTGLGMR KMDPLRAMCR PRPIMSKLLL |
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See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)