AT4G36770.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.863 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : UDP-Glycosyltransferase superfamily protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
UDP-Glycosyltransferase superfamily protein; FUNCTIONS IN: UDP-glycosyltransferase activity, transferase activity, transferring glycosyl groups; INVOLVED IN: metabolic process; LOCATED IN: cellular_component unknown; EXPRESSED IN: embryo, sepal, flower, pedicel, synergid; EXPRESSED DURING: 4 anthesis, C globular stage; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase (InterPro:IPR002213); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: UDP-glucosyl transferase 72E1 (TAIR:AT3G50740.1); Has 8229 Blast hits to 8179 proteins in 484 species: Archae - 0; Bacteria - 520; Metazoa - 2565; Fungi - 32; Plants - 4963; Viruses - 88; Other Eukaryotes - 61 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:-:17330217..17331590 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 50816.80 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.65 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.07 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 457 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MELHGALVAS PGMGHAVPIL ELGKHLLNHH GFDRVTVFLV TDDVSRSKSL IGKTLMEEDP KFVIRFIPLD VSGQDLSGSL LTKLAEMMRK ALPEIKSSVM 101: ELEPRPRVFV VDLLGTEALE VAKELGIMRK HVLVTTSAWF LAFTVYMASL DKQELYKQLS SIGALLIPGC SPVKFERAQD PRKYIRELAE SQRIGDEVIT 201: ADGVFVNTWH SLEQVTIGSF LDPENLGRVM RGVPVYPVGP LVRPAEPGLK HGVLDWLDLQ PKESVVYVSF GSGGALTFEQ TNELAYGLEL TGHRFVWVVR 301: PPAEDDPSAS MFDKTKNETE PLDFLPNGFL DRTKDIGLVV RTWAPQEEIL AHKSTGGFVT HCGWNSVLES IVNGVPMVAW PLYSEQKMNA RMVSGELKIA 401: LQINVADGIV KKEVIAEMVK RVMDEEEGKE MRKNVKELKK TAEEALNMTH IPSAYFT |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)