AT4G36750.1
|
Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 1.000 What is SUBAcon? |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Experimental Localisations and PPI |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Description (TAIR10) | protein_coding : Quinone reductase family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
Quinone reductase family protein; FUNCTIONS IN: oxidoreductase activity, FMN binding; INVOLVED IN: negative regulation of transcription; LOCATED IN: plasma membrane; EXPRESSED IN: 24 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Flavoprotein WrbA (InterPro:IPR010089), Flavodoxin/nitric oxide synthase (InterPro:IPR008254); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: flavodoxin-like quinone reductase 1 (TAIR:AT5G54500.1); Has 3509 Blast hits to 3505 proteins in 1117 species: Archae - 64; Bacteria - 2674; Metazoa - 2; Fungi - 274; Plants - 203; Viruses - 1; Other Eukaryotes - 291 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Coordinates (TAIR10) | chr4:+:17324642..17326215 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 28756.10 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 4.96 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.21 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 273 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MGKGGGCVPS KKKKPATTGD GPGIDDDNDA TNAPIQIDDD QTTIDGDRTT ATNTGGTTTP AITTTAAKIS SPLKIFVVFY SMYGHVESLA KRMKKGVDSV 101: EGVEATLYRV PETLSQEVVE QMKAPVKDLE IPEITAAELT AADGFLFGFP TRYGCMAAQM KAFFDSTGSL WKEQSLAGKP AGFFVSTGTQ GGGQETTAWT 201: AITQLVHHGM LFVPIGYTFG AGMFKMDSIR GGSPYGAGVF AGDGSREATE TELALAEHQG NYMAAIVKRL AQP |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| See Also |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)