AT4G36720.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:mitochondrion 0.954 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : HVA22-like protein K | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
HVA22-like protein K (HVA22K); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: TB2/DP1/HVA22 related protein (InterPro:IPR004345); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: HVA22 homologue B (TAIR:AT5G62490.1); Has 1515 Blast hits to 1515 proteins in 211 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 701; Fungi - 226; Plants - 493; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 95 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:+:17307769..17309668 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 22154.50 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.25 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.04 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 200 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MSGFASQIPS MALLGSGLTG EVGLRVLFSP LSSNIVLRTA CCSIGIGLPV YSTFKAIESG DENEQQKMLI YWAAYGSFSL VEVFTDKIIS WFPLYYHVKF 101: AFLVWLQLPT VEGSKQIYNN QIRPFLLRHQ ARVDQLVDGV YGEMVKVVRS HQGEIRFVRA MIAKILGSVN EDAPRLGEIA NGSPVSETNS DSESDSNHED |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)