AT4G36070.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 1.000 ASURE: plasma membrane What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : calcium-dependent protein kinase 18 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
member of Calcium Dependent Protein Kinase | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
calcium-dependent protein kinase 18 (CPK18); FUNCTIONS IN: protein serine/threonine kinase activity, calmodulin-dependent protein kinase activity, protein kinase activity, ATP binding, calcium ion binding; INVOLVED IN: protein amino acid phosphorylation, N-terminal protein myristoylation; EXPRESSED IN: sperm cell, male gametophyte; EXPRESSED DURING: M germinated pollen stage; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein kinase, ATP binding site (InterPro:IPR017441), EF-Hand 1, calcium-binding site (InterPro:IPR018247), Serine/threonine-protein kinase domain (InterPro:IPR002290), EF-hand-like domain (InterPro:IPR011992), Calcium-binding EF-hand (InterPro:IPR002048), Serine/threonine-protein kinase-like domain (InterPro:IPR017442), Protein kinase-like domain (InterPro:IPR011009), Serine/threonine-protein kinase, active site (InterPro:IPR008271), Protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR000719), EF-HAND 2 (InterPro:IPR018249), Calcium-dependent protein kinase (InterPro:IPR020642), Calcium/calmodulin-dependent protein kinase-like (InterPro:IPR020636); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: calcium-dependent protein kinase 16 (TAIR:AT2G17890.1); Has 123753 Blast hits to 121604 proteins in 3839 species: Archae - 181; Bacteria - 14516; Metazoa - 45843; Fungi - 14448; Plants - 26576; Viruses - 602; Other Eukaryotes - 21587 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:-:17056907..17059595 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 60216.80 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.94 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.55 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 534 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MGLCFSSPKA TRRGTGSRNP NPDSPTQGKA SEKVSNKNKK NTKKIQLRHQ GGIPYGKRID FGYAKDFDNR YTIGKLLGHG QFGFTYVATD NNNGNRVAVK 101: RIDKAKMTQP IEVEDVKREV KILQALGGHE NVVGFHNAFE DKTYIYIVME LCDGGELLDR ILAKKDSRYT EKDAAVVVRQ MLKVAAECHL RGLVHRDMKP 201: ENFLFKSTEE GSSLKATDFG LSDFIKPGVK FQDIVGSAYY VAPEVLKRRS GPESDVWSIG VITYILLCGR RPFWDKTQDG IFNEVMRKKP DFREVPWPTI 301: SNGAKDFVKK LLVKEPRARL TAAQALSHSW VKEGGEASEV PIDISVLNNM RQFVKFSRLK QIALRALAKT INEDELDDLR DQFDAIDIDK NGSISLEEMR 401: QALAKDVPWK LKDARVAEIL QANDSNTDGL VDFTEFVVAA LHVNQLEEHD SEKWQQRSRA AFDKFDIDGD GFITPEELRL QTGLKGSIEP LLEEADVDED 501: GRISINEFRR LLRSASLKSK NVKSPPGYQL SQKM |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)