AT4G35650.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:mitochondrion 1.000 ASURE: mitochondrion What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : isocitrate dehydrogenase III | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a regulatory subunit of the mitochondrially-localized NAD+- dependent isocitrate dehydrogenase. In contrast to the broadly expressed other regulatory (IDH-I and IDH-II) and catalytic (IDH-V and IDH-VI) subunits of this enzyme, IDH-III expression appears to be restricted largely to pollen. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
isocitrate dehydrogenase III (IDH-III); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Isocitrate/isopropylmalate dehydrogenase (InterPro:IPR001804), Isocitrate dehydrogenase NAD-dependent, mitochondrial (InterPro:IPR004434); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: isocitrate dehydrogenase 1 (TAIR:AT4G35260.1); Has 1807 Blast hits to 1807 proteins in 277 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 736; Fungi - 347; Plants - 385; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 339 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:+:16908584..16909973 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 39959.60 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.50 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.03 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 368 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MARRSVSIFN RLLANPPSPF TSLSRSITYM PRPGDGAPRT VTLIPGDGIG PLVTGAVEQV MEAMHAPVHF ERYEVLGNMR KVPEEVIESV KRNKVCLKGG 101: LATPVGGGVS SLNMQLRKEL DIFASLVNCI NVPGLVTRHE NVDIVVIREN TEGEYSGLEH EVVPGVVESL KVITKFCSER IARYAFEYAY LNNRKKVTAV 201: HKANIMKLAD GLFLESCREV AKHYSGITYN EIIVDNCCMQ LVAKPEQFDV MVTPNLYGNL IANTAAGIAG GTGVMPGGNV GAEHAIFEQG ASAGNVGNDK 301: MVEQKKANPV ALLLSSAMML RHLRFPTFAD RLETAVKQVI KEGKYRTKDL GGDCTTQEVV DAVIAALE |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)