AT4G34660.3
Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min: :max .
SUBAcon:mitochondrion 0.953 What is SUBAcon? |
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Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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Description (TAIR10) | protein_coding : SH3 domain-containing protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Curator Summary (TAIR10) |
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Computational Description (TAIR10) |
SH3 domain-containing protein; FUNCTIONS IN: clathrin binding; INVOLVED IN: biological_process unknown; EXPRESSED IN: 23 plant structures; EXPRESSED DURING: 14 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Src homology-3 domain (InterPro:IPR001452); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: SH3 domain-containing protein (TAIR:AT4G18060.1). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Annotations |
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Coordinates (TAIR10) | chr4:-:16545595..16548294 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Weight (calculated) | 35421.20 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IEP (calculated) | 9.14 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GRAVY (calculated) | -0.59 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Length | 317 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MDAIRKQASR LREQVARQQQ AVFKQFGGGG YGSGLADEAE LNQHQKLEKL YISTRAAKHY QRDIVRGVEG YIVTGSKQVE IGTKLSEDSR KYGSENTCTN 101: GNVLTRAALN YGRARAQMEK ERGNMLKALG TQVAEPLRAM VLGAPLEDAR HLAQRYDRMR QEAEAQATEV ARRQAKARES QGNPDILMKL ESAEAKLHDL 201: KSNMTILGKE AASALASVED QQQKLTLERL LSMVESERAY HQRVLQILDQ LEGEVLFPYH GVTDVELSLS TGEYVVVRKV TGSGWAEGEC KGKAGWFPYG 301: YIERRERVLA SKVSEVF |
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See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)