AT4G34240.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : aldehyde dehydrogenase 3I1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Aldehyde dehydrogenase induced by ABA and dehydration | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
aldehyde dehydrogenase 3I1 (ALDH3I1); FUNCTIONS IN: 3-chloroallyl aldehyde dehydrogenase activity, aldehyde dehydrogenase (NAD) activity; INVOLVED IN: response to water deprivation, response to abscisic acid stimulus; LOCATED IN: chloroplast, plastid; EXPRESSED IN: 26 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Aldehyde/histidinol dehydrogenase (InterPro:IPR016161), Aldehyde dehydrogenase (InterPro:IPR015590), Aldehyde dehydrogenase, N-terminal (InterPro:IPR016162), Aldehyde dehydrogenase NAD(P)-dependent (InterPro:IPR012394), Aldehyde dehydrogenase, conserved site (InterPro:IPR016160); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: aldehyde dehydrogenase 3H1 (TAIR:AT1G44170.2); Has 30201 Blast hits to 17322 proteins in 780 species: Archae - 12; Bacteria - 1396; Metazoa - 17338; Fungi - 3422; Plants - 5037; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2996 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:+:16389801..16392633 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 60176.00 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.72 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.05 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 550 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MTKLLEINHI QTLCFAKGFS PARLNVATSP FRISRRGGGG YCSNACIPYR LKFTCYATLS AVVKEQASDF SGKEAALLVD ELRSNFNSGR TKSYEWRISQ 101: LQNIARMIDE KEKCITEALY QDLSKPELEA FLAEISNTKS SCMLAIKELK NWMAPETVKT SVTTFPSSAQ IVSEPLGVVL VISAWNFPFL LSVEPVIGAI 201: AAGNAVVLKP SEIAPAASSL LAKLFSEYLD NTTIRVIEGG VPETTALLDQ KWDKIFFTGG ARVARIIMAA AARNLTPVVL ELGGKCPALV DSDVNLQVAA 301: RRIIAGKWAC NSGQACIGVD YVITTKDFAS KLIDALKTEL ETFFGQNALE SKDLSRIVNS FHFKRLESML KENGVANKIV HGGRITEDKL KISPTILLDV 401: PEASSMMQEE IFGPLLPIIT VQKIEDGFQV IRSKPKPLAA YLFTNNKELE KQFVQDVSAG GITINDTVLH VTVKDLPFGG VGESGIGAYH GKFSYETFSH 501: KKGVLYRSFS GDADLRYPPY TPKKKMVLKA LLSSNIFAAI LAFFGFSKDS |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)