AT4G32840.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 1.000 ASURE: cytosol What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : phosphofructokinase 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
phosphofructokinase 6 (PFK6); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Pyrophosphate-dependent phosphofructokinase TP0108 (InterPro:IPR012004), Phosphofructokinase (InterPro:IPR000023); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: phosphofructokinase 1 (TAIR:AT4G29220.1); Has 8046 Blast hits to 7506 proteins in 2189 species: Archae - 28; Bacteria - 5254; Metazoa - 679; Fungi - 399; Plants - 394; Viruses - 4; Other Eukaryotes - 1288 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:-:15845010..15848305 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 50790.90 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.08 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.17 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 462 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MASNGVDEQI KLVEGPAGYV LEDVPHLSDY ILDLPTYPNP LQSNAAYSVV RQYFVDEDDT VQEKIVVHKD SPRGTHFRRA GPRQKVYFKP SDVRACIVTC 101: GGLCPGLNTV IREIVCGLHF MYGVTEVIGV DCGFRGFYSK NTVALTPKTV SDIHKRGGTI LGTSRGGHDT SKIVDNIQDR EINQVYIIGG DGTQKGANAI 201: YKEIRRRGLK VAVAGIPKTI DNDIPVIDKS FGFDTAVEEA QRAINAAHVE ATSVENGIGI VKLMGRYSGF IAMYATLASR DVDCCLIPES PFYLEGKGGL 301: YEFIAKRLRE NGHMVIVIAE GAGQDLVAES IEQQDASGNK LLKDVGLWMS LKIKEYFAKH NVMDITLKYI DPTYMIRAIP ANASDNVYST LLAQSAVHGA 401: MAGYTGFVSG LVNGRHTYIP FNRITERQNK VVITDRMWAR MLSSTNQPSF MNPPKGTTEF TD |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)