AT4G32285.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : ENTH/ANTH/VHS superfamily protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
ENTH/ANTH/VHS superfamily protein; FUNCTIONS IN: phospholipid binding, clathrin binding, binding, phosphatidylinositol binding; INVOLVED IN: clathrin coat assembly; LOCATED IN: cytosol, nucleus, plasma membrane; EXPRESSED IN: guard cell, cultured cell; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Epsin-like, N-terminal (InterPro:IPR013809), ANTH (InterPro:IPR011417), ENTH/VHS (InterPro:IPR008942), Clathrin adaptor, phosphoinositide-binding, GAT-like (InterPro:IPR014712); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: epsin N-terminal homology (ENTH) domain-containing protein / clathrin assembly protein-related (TAIR:AT2G25430.1); Has 30201 Blast hits to 17322 proteins in 780 species: Archae - 12; Bacteria - 1396; Metazoa - 17338; Fungi - 3422; Plants - 5037; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2996 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:+:15586003..15587910 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 70558.50 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.99 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.54 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 635 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MALSMRKAIG VVKDQTSIGI AKVASNMAPD LEVAIVKATS HDDDQSSDKY IREILSLTSL SRGYVHACVT SVSRRLKKTR DWIVALKALM LVHRLLNEGD 101: PLFQEEILYA TRRGTRILNM SDFRDEAHSS SWDHSAFVRT YASYLDQRLE LALFERRGRN GGGSSSSHQS NGDDGYNRSR DDFRSPPPRT YDYETGNGFG 201: MPKRSRSFGD VNEIGAREEK KSVTPLREMT PERIFGKMGH LQRLLDRFLS CRPTGLAKNS RMILIAMYPV VKESFRLYAD ICEVLAVLLD KFFDMEYTDC 301: VKAFDAYASA AKQIDELIAF YHWCKDTGVA RSSEYPEVQR ITSKLLETLE EFVRDRAKRA KSPERKEIEA PPAPAPPVEE PVDMNEIKAL PPPENHTPPP 401: PPAPEPKPQQ PQVTDDLVNL REDDVSGDDQ GNKFALALFA GPPANNGKWE AFSSDNNVTS AWQNPAAELG KADWELALVE TASNLEHQKA AMGGGLDPLL 501: LNGMYDQGAV RQHVSTSELT GGSSSSVALP LPGKVNSHIL ALPAPDGTVQ KVNQDPFAAS LTIPPPSYVQ MAEMDKKQYL LTQEQQLWQQ YQQEGMRGQA 601: SLAKMNTAQT AMPYGMPPVN GMGPSPMGYY YNNPY |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)