AT4G31010.1
|
Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:mitochondrion 1.000 ASURE: mitochondrion What is SUBAcon? |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Experimental Localisations and PPI |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Description (TAIR10) | protein_coding : RNA-binding CRS1 / YhbY (CRM) domain-containing protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
RNA-binding CRS1 / YhbY (CRM) domain-containing protein; FUNCTIONS IN: RNA binding; INVOLVED IN: biological_process unknown; LOCATED IN: mitochondrion; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: RNA-binding, CRM domain (InterPro:IPR001890); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: RNA-binding CRS1 / YhbY (CRM) domain-containing protein (TAIR:AT5G54890.1); Has 267 Blast hits to 236 proteins in 12 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 0; Fungi - 0; Plants - 267; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 0 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Coordinates (TAIR10) | chr4:+:15106708..15108446 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 46395.70 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.90 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 405 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MFLIRLSRHN PSSFTLLTRR LHDQTISSSR LRDLYNFQSP PPLSSSASEN PDFNQKNNNK KKPKPQYRPP SSLEGVKTVH SDLPFDFRFS YTESCSNVRP 101: IGLREPKYSP FGPDRLDREW TGVCAPAVNP KVESVDGVED PKLEEKRRKV REKIQGASLT EAERKFLVEL CQRNKTKRQV NLGRDGLTHN MLNDVYNHWK 201: HAEAVRVKCL GVPTLDMKNV IFHLEDKTFG QVVSKHSGTL VLYRGRNYDP KKRPKIPLML WKPHEPVYPR LIKTTIDGLS IDETKAMRKK GLAVPALTKL 301: AKNGYYGSLV PMVRDAFLVS ELVRIDCLGL ERKDYKKIGA KLRDLVPCIL VTFDKEQVVI WRGKDYKPPK EDDEYSSFIH RESSIDSDVD LSCSRGAQDS 401: PDETT |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| See Also |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)