AT4G30910.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Cytosol aminopeptidase family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Cytosol aminopeptidase family protein; FUNCTIONS IN: manganese ion binding, metalloexopeptidase activity, aminopeptidase activity; INVOLVED IN: proteolysis, protein metabolic process; LOCATED IN: chloroplast; EXPRESSED IN: guard cell; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Peptidase M17, leucyl aminopeptidase, C-terminal (InterPro:IPR000819), Peptidase M17, leucyl aminopeptidase, N-terminal (InterPro:IPR008283), Peptidase M17, leucyl aminopeptidase (InterPro:IPR011356); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Cytosol aminopeptidase family protein (TAIR:AT4G30920.1); Has 9759 Blast hits to 9756 proteins in 2005 species: Archae - 18; Bacteria - 5365; Metazoa - 661; Fungi - 36; Plants - 124; Viruses - 1; Other Eukaryotes - 3554 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:-:15042621..15045248 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 61293.50 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.68 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.07 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 581 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAVTLVTSCA SSSRFHFRSF SSSPSSLSSC FVRFQLLSRL RVSFAITPLY CSSKATAHTI AHATLGLTQA NSVDHPKISF SGKEIDVTEW KGDILAVGVT 101: EKDMAKDANS KFENPILKKL DAHLGGLLAD VSAEEDFSGK PGQSTVLRLP GLGSKRVGLI GLGKSASTPS AFQSLGEAVA AAAKASQASS VAVVLASSES 201: FSDESKLSSA SDIASGTVLG LFEDSRYKSE SKKPSLKSVV FIGFGTGPEL ENKLKYAEHV SYGVIFTKEL VNSPANVLSP AVLAEEASNL ASMYSNVMTA 301: NILKEEQCKE LKMGSYLAVA AASANPPHFI HLIYKPSSGP VKTKLALVGK GLTFDSGGYN IKIGPELIIE LMKIDVGGSA AVLGAAKAIG EIKPPGVEVH 401: FIVAACENMI SGTGMRPGDV ITASNGKTIE VNDTDSEGRL TLADALVYAC NQGVDKIVDI ATLTGEIIVA LGPSMAGMYT ASDELAKEVI AASQRSGEKL 501: WRMPMEESYW EMMKSGVADM VNFGGRAGGS ITAALFLKRF VSENVEWLHI DMAGRVWNEK KKAATGFGVA TLVEWVQNNS S |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)