AT4G30300.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.999 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : non-intrinsic ABC protein 15 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
member of NAP subfamily | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
non-intrinsic ABC protein 15 (NAP15); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: ATPase, AAA+ type, core (InterPro:IPR003593), ABC transporter-like (InterPro:IPR003439); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: RNAse l inhibitor protein 2 (TAIR:AT4G19210.1); Has 178874 Blast hits to 170972 proteins in 3466 species: Archae - 4111; Bacteria - 144876; Metazoa - 3882; Fungi - 1523; Plants - 1775; Viruses - 14; Other Eukaryotes - 22693 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:-:14831005..14831550 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 20633.10 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.84 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.31 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 181 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MTITRGDFKL RLNQGEFTDS QIIVMLGENG TGKTTFIKML AGSKLDIDEE GSQVHEIPQF SVSYKNQHMS NRKFEITVRD LIHRKIPNAY AEHQFVSDVM 101: KPLKIEELMD KSFNKLSGGE KQRVALALCL GKSADIYLID EPSAFLDSEQ RIIASKVIKR FILQMKKAAF ARFHNGYVFG R |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)