AT4G29460.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:extracellular 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Phospholipase A2 family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Phospholipase A2 family protein; FUNCTIONS IN: phospholipase A2 activity; INVOLVED IN: phospholipid metabolic process, lipid catabolic process; LOCATED IN: endomembrane system; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Phospholipase A2 (InterPro:IPR016090), Phospholipase A2, active site (InterPro:IPR013090); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Phospholipase A2 family protein (TAIR:AT4G29470.1); Has 273 Blast hits to 273 proteins in 60 species: Archae - 0; Bacteria - 21; Metazoa - 140; Fungi - 0; Plants - 108; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 4 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:-:14483066..14483930 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 20039.40 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.15 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 187 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MITGLALSRV AFGLTAFLLL AVVSSQEKCS NTCIAQNCNS LGIRYGKYCG IGYFGCPGEP PCDDLDACCM THDNCVDLKG MTYVNCHKQF KRCVNKLSKS 101: IKHSNGEKIG FSTQCPYSIV IPTVFNGMDY GIFFSGIGNI FNPPVLGSVP VVEVDLARSK VDTKDGLGTK LGLQTKEGSK VSASLNI |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)