AT4G28130.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.962 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : diacylglycerol kinase 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
diacylglycerol kinase 6 (DGK6); FUNCTIONS IN: diacylglycerol kinase activity; INVOLVED IN: activation of protein kinase C activity by G-protein coupled receptor protein signaling pathway; LOCATED IN: chloroplast; EXPRESSED IN: 13 plant structures; EXPRESSED DURING: 8 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Diacylglycerol kinase, catalytic domain (InterPro:IPR001206), Diacylglycerol kinase, accessory domain (InterPro:IPR000756); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: diacylglycerol kinase 5 (TAIR:AT2G20900.2); Has 1411 Blast hits to 1223 proteins in 132 species: Archae - 0; Bacteria - 5; Metazoa - 1001; Fungi - 0; Plants - 258; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 147 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:+:13971552..13974323 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 52492.70 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.14 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.43 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 466 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MVQSETSMEK YKNLSDFLKK FFIPSYVLSP EDEPEAQISC TTAPENPILV FINSKSGGQL GAELILTYRT LLNDKQVFDL EVETPDKVLQ RIYLNLERLK 101: DDSLASKIRD KLKIIVAGGD GTAGWLLGVV SDLNLSNPPP IATVPLGTGN NLPFAFGWGK KNPGTDRSSV ESFLGKVINA KEMKIDNWKI LMRMKHPKEG 201: SCDITLKLPH SLPRIFPSDQ ENMEGYHTYR GGFWNYFSLG MDAQVSYAFH SQRKLHPERF KNQLVNQSTY LKLSCTQGWF FASLFHPSSQ NIAKLAKIQI 301: CDRNGQWNDL HIPQSIRSIV CLNLPSFSGG LNPWGTPNPK KQRDRSLTAP FVDDGLIEIV GFRNAWHGLI LLSPNGHGTR LAQANRVRLE FKKGAAKHAY 401: MRIDGEPWKQ PLPSNDETVM VEISHHGQVN MLATQNCRSK SMYESSSIIR FSNDEDDSSV VENEEF |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)