AT4G26485.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 0.996 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Domain of unknown function (DUF2431) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Domain of unknown function DUF2431 (InterPro:IPR019446); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Domain of unknown function (DUF2431) (TAIR:AT1G55790.1). | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:-:13377685..13378390 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 19647.20 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.63 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.61 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 171 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MNITATSLDS EDELSIKYMD AVDNINILKR YGCDIQHEVD VHTMSFDNSL SLQRYDRIVF NFPHAGSRFF GRELSSRAIE SHKELVRGFL ENAKEMLEED 101: GEIHITHKTT YPFSDWGIKK LGKGEGLKLL KKSKFELSHY PGYITKRGSG GRRSDDYFPV GECSTYMFTQ S |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)