AT4G26390.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.890 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Pyruvate kinase family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Pyruvate kinase family protein; FUNCTIONS IN: pyruvate kinase activity, potassium ion binding, magnesium ion binding, catalytic activity; INVOLVED IN: glycolysis; LOCATED IN: cellular_component unknown; EXPRESSED IN: leaf whorl, sperm cell, flower; EXPRESSED DURING: 4 anthesis; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Pyruvate kinase, C-terminal-like (InterPro:IPR015795), Pyruvate kinase, active site (InterPro:IPR018209), Pyruvate kinase, beta-barrel-like (InterPro:IPR011037), Pyruvate kinase, alpha/beta (InterPro:IPR015794), Pyruvate/Phosphoenolpyruvate kinase, catalytic core (InterPro:IPR015813), Pyruvate kinase (InterPro:IPR001697), Pyruvate kinase, barrel (InterPro:IPR015793); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Pyruvate kinase family protein (TAIR:AT5G56350.1); Has 10229 Blast hits to 10134 proteins in 2721 species: Archae - 168; Bacteria - 6082; Metazoa - 550; Fungi - 222; Plants - 538; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2669 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:+:13342207..13344418 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 54322.60 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.99 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.01 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 497 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAMEQRPKTK IVCTLGPASR SVPMVEKLLM AGMSVARFNF SHGSYEYHQE TLDNLRQAML NTGMLCAVML DTKGPEIRTG FLKDGKPIQL KQGQEITIST 101: DYDLKGDEKT ICMSYKKLAQ DVNPGMVILC ADGTISLKVL SCDKEKGTVR CRCENTSMLG ERKNVNLPGV VVDLPTLTEK DKQDILEWGV PNQIDMIALS 201: FVRKGSDLVQ VRKLLGKHAK TILLMSKVEN QEGVANFDDI LINSDAFMIA RGDLGMEIPI EKIFLAQKVM IYKCNFMGKP VVTATQMLES MIKSPRPTRA 301: EATDVANAVL DGTDCVMLSG ETAAGAYPEL AVRTMAKICV EAESTLDYGD IFKRIMLHAA VPMSPMESLA SSAVRTATSS RATLMMVLTR GGSTARLVAK 401: YRPGIPILSV VVPEITSDSF DWACSNEAPA RHSLIYRGLV PVLYAGSARA SIDESTEETL EFASEYGKKK QLCKTGDSVV ALFRTGNAIV IKILTVK |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)