AT4G26250.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : galactinol synthase 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
galactinol synthase 6 (GolS6); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Glycosyl transferase, family 8 (InterPro:IPR002495); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: galactinol synthase 5 (TAIR:AT5G23790.1); Has 1309 Blast hits to 1308 proteins in 306 species: Archae - 0; Bacteria - 175; Metazoa - 257; Fungi - 268; Plants - 476; Viruses - 67; Other Eukaryotes - 66 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:+:13289641..13291053 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 38852.60 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 4.83 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.19 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 336 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAQMSMTVEK SIKADVTVSH DRVKRAYVTF LAGNKDYWMG VVGLAKGLRK VKSAYPLVVA ILPDVPEEHR QILLAQGCII REIEPVYPPE NKTGYSMAYY 101: VINYSKLRIW EFVEYEKMIY LDGDIQVFSN IDHLFDTPRG YLYAVKDCFC EISWSKTPQF KIGYCQQCPE KVTWPVESLG SPPPVYFNAG MLVFEPNLLT 201: YEDLLRVVQI TTPTYFAEQD FLNEYFTDIY KPIPSTYNLV MAMLWRHPEH IDLDQISVIH YCANGSKPWR FDETEEHMDR EDIKMLVKKW WDIYEDSSLD 301: YKNFVETESK LSPINATLAS KESVGDVLIS LAPSAA |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)