AT4G26180.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:mitochondrion 1.000 ASURE: mitochondrion What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Mitochondrial substrate carrier family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Mitochondrial substrate carrier family protein; FUNCTIONS IN: binding, transporter activity; INVOLVED IN: transport, mitochondrial transport, transmembrane transport; LOCATED IN: mitochondrial inner membrane, membrane; EXPRESSED IN: 9 plant structures; EXPRESSED DURING: M germinated pollen stage, 4 anthesis, petal differentiation and expansion stage, E expanded cotyledon stage, D bilateral stage; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Mitochondrial carrier protein (InterPro:IPR002067), Mitochondrial substrate carrier (InterPro:IPR001993), Mitochondrial substrate/solute carrier (InterPro:IPR018108), Adenine nucleotide translocator 1 (InterPro:IPR002113); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Mitochondrial substrate carrier family protein (TAIR:AT1G14560.1); Has 27152 Blast hits to 14144 proteins in 467 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 12042; Fungi - 7753; Plants - 4485; Viruses - 3; Other Eukaryotes - 2869 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:-:13260263..13261887 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 36553.80 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 10.02 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.07 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 325 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAEGEEKNGI IDSIPLFAKE LIAGGVTGGI AKTAVAPLER IKILFQTRRD EFKRIGLVGS INKIGKTEGL MGFYRGNGAS VARIVPYAAL HYMAYEEYRR 101: WIIFGFPDTT RGPLLDLVAG SFAGGTAVLF TYPLDLVRTK LAYQTQVKAI PVEQIIYRGI VDCFSRTYRE SGARGLYRGV APSLYGIFPY AGLKFYFYEE 201: MKRHVPPEHK QDISLKLVCG SVAGLLGQTL TYPLDVVRRQ MQVERLYSAV KEETRRGTMQ TLFKIAREEG WKQLFSGLSI NYLKVVPSVA IGFTVYDIMK 301: LHLRVPPREE PEAEAVTTRK RKVFT |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)