AT4G25650.2
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : ACD1-like | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Similar to ACD1. Leaves of antisense ACD1-like plants turn yellow in darkness like wild-type whereas antisense ACD1 plants remain dark after five days of dark treatment. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
ACD1-like (ACD1-LIKE); FUNCTIONS IN: electron carrier activity, oxidoreductase activity, 2 iron, 2 sulfur cluster binding, chlorophyllide a oxygenase [overall] activity; INVOLVED IN: oxidation reduction; LOCATED IN: chloroplast, chloroplast envelope; EXPRESSED IN: 24 plant structures; EXPRESSED DURING: 15 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Rieske [2Fe-2S] iron-sulphur domain (InterPro:IPR017941), Pheophorbide a oxygenase (InterPro:IPR013626); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Pheophorbide a oxygenase family protein with Rieske [2Fe-2S] domain (TAIR:AT3G44880.1); Has 3440 Blast hits to 3433 proteins in 618 species: Archae - 4; Bacteria - 2370; Metazoa - 19; Fungi - 3; Plants - 426; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 618 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:-:13081021..13083153 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 63821.70 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.81 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.29 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 559 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MEAALAACAL PSLRILNTKP RFRCSFSNPS LPISPNSLIT RKSSRFTTAV SSPPSSSAAT STNSPPEPEA LFEPGSDKFD WYANWYPVMP ICDLDKKVPH 101: GKKVMGIDLV VWWDRNEKQW KVMDDTCPHR LAPLSDGRID QWGRLQCVYH GWCFNGSGDC KLIPQAPPDG PPVHTFKQAC VAVYPSTVQH EIIWFWPNSD 201: PKYKNIIETN KPPYIPELED PSFTKLMGNR DIPYGYDVLV ENLMDPAHVP YAHYGLMRFP KPKGKYIICI SNSCFNPFTN LQILLAEKID REGGKPLEIN 301: VKKLDNKGFF SKQEWGYSNF IAPCVYRSST DPLPEQEHEY PAPAASDKAA LSKRRLSLIF ICIPVSPGRS RLIWTFPRNF GVFIDKIVPR WVFHIGQNTI 401: LDSDLHLLHV EERKILERGP ENWQKACFIP TKSDANVVTF RRWFNKYSEA RVDWRGKFDP FLLPPTPPRE QLFDRYWSHV ENCSSCKKAH KYLNALEVIL 501: QIASVAMIGV MAVLKQTTMS NVARIAVLVA AVLSFAASKW LSHFIYKTFH YHDYNHAVV |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)