AT4G24830.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : arginosuccinate synthase family | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
arginosuccinate synthase family; FUNCTIONS IN: argininosuccinate synthase activity, ATP binding; INVOLVED IN: arginine biosynthetic process; LOCATED IN: chloroplast stroma, chloroplast; EXPRESSED IN: 25 plant structures; EXPRESSED DURING: 15 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Rossmann-like alpha/beta/alpha sandwich fold (InterPro:IPR014729), Argininosuccinate synthase, conserved site (InterPro:IPR018223), Argininosuccinate synthase (InterPro:IPR001518); Has 8298 Blast hits to 8290 proteins in 2389 species: Archae - 194; Bacteria - 4604; Metazoa - 152; Fungi - 155; Plants - 73; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 3120 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:-:12793085..12795857 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 53848.60 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.64 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.20 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 494 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAEISATSFP SSSSSALVIR SSHNGSLKCQ NVAVPKTTSQ FQELSLKRSQ LVGNAVVTGH VTGSRSCKNQ AIRAVLSGDG TALTTDSKEA GLRGKLKKVV 101: LAYSGGLDTS VIVPWLKENY GCEVVCFTAD VGQGIKELEG LEQKAKASGA SQLVVKDLTE EFVKDFIFPC LRAGAIYERK YLLGTSMARP VIAKAMVDVA 201: AEVGADAVAH GCTGKGNDQV RFELTFFSLN PELKVVAPWR EWEIQGREDA IEYAKKHNVP VPVTKKSIYS RDRNLWHLSH EGDLLEDPAN EPKKDMYMMS 301: VDPEDAPDQP EYIEIGIESG LPVALNGKAL SPATLLAELN TIGGKHGIGR IDMVENRLVG MKSRGVYETP GGTILFAAVQ ELESLTLDRE SIQVKDTLAL 401: KYAEMVYAGR WFDPLRESMD AFMEKITETT TGSVTLKLYK GSVSVTGRQS PNSLYRQDIS SFEGSEIYNQ ADAAGFIRLY GLPMKIRAML KKIS |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)